Голкипер «Томи» Алексей Ботвиньев, в декабре 2010 года подписавший трехлетний контракт с клубом, выставлен на трансфер.
Из состава, который завершал чемпионат в премьер-лиге, в Томске остались: вратарь Илья Чебану, защитники Илья Гультяев, Сергей Сосновский, лечащийся после травмы, Виктор Строев, Сергей Омельянчук, полузащитник Дмитрий Никитинский, нападающие Никита Баженов, Кирилл Погребняк, Антон Хазов. На просмотре находится полузащитник «Нижнего Новгорода» Александр Черевко. Кроме того, «Томь» намерена сохранить в составе легионеров вратаря Петра Вашека и защитника Пламена Николова. Вашек, являющийся свободным агентом, 20 июня должен пройти в Москве медобследование. Что касается Николова, бывшего в «Томи» в аренде, то сейчас рассматривается вариант покупки болгарина у «Литекса».